| 课题名称 | 项目来源 | 起止时间 |
| 免疫细胞的可塑性和代谢调控 | 科技部国家重点研发计划项目主持 | 2023-2028 |
| 免疫细胞发育、分化和代谢调控机制 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2023-2028 |
| 多尺度邻近标记解析组织微环境调控肝脏前体细胞分化的机制 | 科技部国家重点研发计划项目主持 | 2023-2028 |
| 微生物组脂质代谢物调节肠道和皮肤发育与稳态建立的研究 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2022-2027 |
| 肺泡损伤修复再生的细胞基础及全细胞图谱绘制 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2023-2027 |
| 精准靶向肿瘤细胞可控死亡的合成生物学研究 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2023-2028 |
| 器官移植后免疫抑制状态下肿瘤发生和复发转移的机制研究及精准诊疗策略建立 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2023-2026 |
| 复杂基因组的稳定遗传机制 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2023-2028 |
| 基于人工智能的免疫制剂肿瘤原位治疗技术体系建立 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2023-2026 |
| DNA甲基化和组蛋白修饰的结构基础、动态调控及靶向干预 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2023-2028 |
| B细胞抗体多样化 | 国家杰出青年科学基金 | 2024-2028 |
| 功能性piRNA鉴定及piRNA调控规则研究 | 基金委重点项目 | 2024-2028 |
| 糖脂代谢重编程驱动肿瘤细胞周期进程的作用与机制 | 基金委重大研究计划 | 2024-2026 |
| 骨折损伤修复过程的信息解码与调控机制研究 | 基金委重大研究计划 | 2024-2026 |
| 多尺度邻近标记技术解析组织微环境调控器官再生的机制 | 基金委重大研究计划 | 2024-2026 |
| 时空多组学解码肝脏损伤的有序修复和再生障碍机制 | 基金委重大研究计划 | 2024-2027 |
| 神经精神药物药理 | 国家杰出青年科学基金 | 2023-2027 |
| 肝脏生物学和免疫学 | 基金委创新研究群体项目 | 2023-2027 |
| PIEZOs蛋白介导髓核力学稳态抑制椎间盘退变的分子机制研究 | 基金委重点项目 | 2023-2027 |
| 精神压力通过抑制RNF168促进肿瘤发生发展的作用机制研究 | 基金委重点项目 | 2023-2027 |
| 成熟RNA核降解的命运决定机制及生物学功能研究 | 基金委重点项目 | 2023-2027 |
| 纤毛感受器中膜蛋白质动态周转的调节机理与功能研究 | 基金委重点项目 | 2023-2027 |
| 基于在体蛋白质伙伴组的组织损伤修复机制研究 | 基金委重大项目 | 2023-2027 |
| 肝脏损伤修复过程中关键蛋白质类群鉴定及相关蛋白质标签小鼠的规模化构建 | 基金委重大项目 | 2023-2027 |
| 肝脏损伤修复过程中蛋白质群体的在体功能机制研究 | 基金委重大项目 | 2023-2027 |
| 环形RNA动态折叠的模拟及功能验证 | 上海市生物医药定向项目 | 2023-2026 |
| 样本特异动态网络标志物方法 | 上海市计算生物学重点专项 | 2023-2026 |
| 哺乳动物性染色体大规模遗传改造新技术的建立及应用 | 上海市合成生物学重点专项 | 2023-2026 |
| 可相分离CAR的技术开发与功能评估 | 上海市细胞与基因治疗专项 | 2023-2026 |
| 人类胰岛体外扩增技术的开发和迭代 | 上海市细胞与基因治疗专项 | 2023-2026 |
| RNA调控在精子形成及男性不育中的新功能机制研究 | 上海市基础研究领域项目 | 2023-2026 |
| 非编码RNA在配子发生及生殖障碍中的功能机制 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2022-2027 |
| 细胞尺度时空组学的动力学刻画和因果推断 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2022-2027 |
| 干细胞成瘤的时空演化规律及干预策略 | 科技部国家重点研发计划项目 | 2022-2027 |
| 干细胞成瘤的治疗靶点及干预策略研究 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2022-2027 |
| 干细胞成瘤的信号调控网络研究 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2022-2027 |
| 间充质干细胞在组织器官稳态维持中的作用机制 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2022-2027 |
| 基于多模态数据的健康临界状态的数学刻画与预警理论 | 基金委重点项目 | 2022-2026 |
| Hilnc调控脂肪代谢的生物学功能及机制研究 | 基金委重点项目 | 2022-2026 |
| 调控纤毛发生及运动的哺乳动物超大分子机器的结构与功能 | 基金委重点项目 | 2022-2026 |
| 肿瘤代谢重塑相关新促癌因子的鉴定、功能和干预策略 | 基金委重大研究计划 | 2022-2025 |
| 糖脂功能代谢物的转运、感知与免疫调控 | 基金委重大研究计划 | 2022-2024 |
| 基于非平衡稳态动力学模型对细胞属性转换在肝损伤再生和肝癌形成的研究 | 基金委重大研究计划 | 2022-2025 |
| 成体干细胞命运调控机理 | 国家杰出青年科学基金 | 2022-2026 |
| 肝脏损伤再生中发育信号和免疫因子交互调控细胞属性转变的研究 | 上海市基础研究重大项目 | 2022-2025 |
| 环形RNA生成代谢的调控与功能 | 科技部国家重点研发计划项目 | 2021-2026 |
| 环形RNA自身生成、代谢的途径和调控机制 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2021-2026 |
| 发展环形RNA基础研究和转化应用的新技术 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2021-2026 |
| 生精微环境调控精子发生的机制 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2021-2024 |
| 肿瘤细胞的代谢调控 | 国家杰出青年科学基金 | 2021-2025 |
| 细胞间粘附信号对肠道上皮细胞可塑性的调控及机制 | 基金委重点项目 | 2021-2025 |
| Hippo信号通路关键靶基因的筛选鉴定及其在细胞命运决定中的作用机制 | 基金委重点项目 | 2021-2025 |
| 在体基因原位激活系统的建立及其在生殖前体细胞发育过程中的应用 | 基金委重点项目 | 2021-2025 |
| 端粒结构可塑性调控与细胞命运抉择中的相变与相分离机制研究 | 基金委重大项目 | 2021-2025 |
| 小细胞肺癌化疗耐药的分子细胞基础及克服策略 | 基金委重点项目 | 2021-2025 |
| Wnt信号调控DNA损伤修复的机制研究及靶向干预 | 基金委重大研究计划 | 2021-2024 |
| 代谢物介导的生物大分子动态修饰在肿瘤转移中的作用及调控机制 | 基金委重大研究计划 | 2021-2024 |
| 胆固醇代谢调控T细胞肿瘤免疫应答的机制研究 | 基金委重大研究计划 | 2021-2024 |
| T细胞的脂质指纹与功能机制研究 | 上海市基础研究重大项目 | 2021-2024 |
| 细胞核亚结构域长非编码RNA图谱（LAND）解码及功能研究 | 中国科学院稳定支持基础研究研究青年团队 | 2021-2026 |
| 代谢驱动的肿瘤转移与免疫治疗 | 中国科学院稳定支持基础研究研究青年团队 | 2021-2026 |
| 系统形成过程中细胞交互作用网络及共性调控机制 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2020-2024 |
| 重要器官细胞增殖与分化过程中关键蛋白质机器的动态调控网络及机制 | 科技部国家重点研发计划项目 | 2020-2025 |
| 发现调控细胞增殖与分化新因子 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2020-2025 |
| 蛋白质机器实时动态在体功能研究 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2020-2025 |
| 蛋白质机器动态网络作用机制研究 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2020-2025 |
| 肠道黏膜免疫关键蛋白质机器的功能机制 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2020-2025 |
| 细胞核亚结构域长非编码RNA (LAND) 图谱绘制及功能研究 | 上海市基础研究重大项目 | 2020-2023 |
| 多组学数据采集与标准化系统 | 中科院战略性先导科技专项B类（项目） | 2020-2024 |
| RNA转运与降解的机制和功能 | 基金委杰青 | 2020-2024 |
| 肿瘤细胞信号转导 | 基金委杰青 | 2020-2024 |
| 卵子染色质动态变化的机制及其在动物生长发育中的调控作用 | 基金委重大项目 | 2020-2024 |
| 纤毛与个体发育器官形成的细胞机制 | 基金委重大项目 | 2020-2024 |
| 骨源性因子对骨骼自身及骨外重要器官/系统稳态维持的作用和机制 | 基金委重大项目 | 2020-2024 |
| 2型糖尿病发生发展过程的临界状态预测理论和生物信息学方法 | 基金委重点 | 2020-2024 |
| 肝脏损伤再生过程巨噬细胞对肝细胞重编程的作用和调控 | 基金委重点 | 2020-2024 |
| RNA甲基化修饰调控减数分裂 | 基金委重点 | 2020-2024 |
| 胆固醇代谢调控巨噬细胞抗感染抗肿瘤的研究 | 基金委重点 | 2020-2024 |
| 遗传谱系示踪与组织再生 | 基金委优青 | 2020-2022 |
| 非编码RNA代谢与功能 | 基金委重大研究计划 | 2020-2022 |
| 非编码RNA在重大疾病发生发展中的作用机制 | 基金委重大研究计划 | 2020-2022 |
| RNA调控与生殖 | 基金委创新群体 | 2019-2024 |
| 早期胚胎发育中甲基化谱式建立的代谢物调控 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2019-2024 |
| 组织器官损伤修复的细胞基础及关键因子 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2019-2024 |
| 组织器官损伤修复过程中信号转导与代谢的交互调控机制 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2019-2024 |
| 心脏和肝脏细胞更新能力差异的分子基础 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2019-2024 |
| 调控代谢性细胞器的信号转导机制 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2019-2024 |
| 组织器官损伤修复的细胞基础与分子调控机制 | 科技部国家重点研发计划项目 | 2019-2024 |
| 免疫细胞介导的炎症相关疾病 | 基金委杰青 | 2019-2023 |
| 绿藻Tet酶及其催化产生的DNA新修饰的功能研究 | 基金委重点 | 2019-2023 |
| 肿瘤胆固醇代谢物介导的免疫逃逸机制研究 | 基金委重点 | 2019-2023 |
| 应答激素的新的乳腺干细胞类型的发现及机制研究 | 基金委重点 | 2019-2023 |
| 小核仁RNA加工来源的两类新型长非编码RNAs的代谢和功能研究 | 基金委重点 | 2019-2023 |
| PIWI-ins元件在PIWI/piRNA调控和男性不育中的功能机制研究 | 基金委重点 | 2019-2023 |
| 细胞微环境钙离子对淋巴细胞黏附可塑性的调控及其机制研究 | 基金委重点 | 2019-2023 |
| 染色体改造单倍体干细胞的构建及应用 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2019-2023 |
| 染色体倍性异常单倍体干细胞的构建及应用 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2019-2023 |
| 移植细胞命运追踪及功能评价 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2019-2023 |
| 建立针对造血干细胞的新型基因编辑技术 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2019-2023 |
| 染色体倍性改造干细胞的建立与应用 | 科技部国家重点研发计划项目 | 2019-2023 |
| 衰老细胞的示踪及其细胞命运可塑性研究 | 基金委重大研究计划 | 2019-2022 |
| 蛋白质生物合成 | 基金委优青 | 2019-2021 |
| 肿瘤发生的细胞信号转导机制 | 基金委优青 | 2019-2021 |
| 利用细胞示踪新技术研究心血管系统细胞命运图谱 | 上海市基础研究重大项目 | 2019-2022 |
| 基于基因组标签计划的蛋白质图谱研究 | 上海市生物医药重大项目 | 2019-2020 |
| T细胞分化调控关键蛋白质机器及功能机制研究 < | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2018-2023 |
| 核受体降解相关蛋白质机器及靶向干预 | 科技部国家重点研发计划项目 | 2018-2023 |
| 长非编码RNA的代谢与功能 | 基金委杰青 | 2018-2022 |
| 骨发育与重建及相关疾病的机制 | 基金委杰青 | 2018-2022 |
| 肿瘤发生及免疫应答的分子细胞信号机制 | 基金委杰青 | 2018-2022 |
| 利用半克隆技术筛选参与早期胚胎发育的关键雌性印记基因 | 基金委重点 | 2018-2022 |
| 遗传操作新技术的建立及应用 | 基金委重点 | 2018-2022 |
| 不同组织间充质干细胞的发育起源与功能亚群鉴定 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2018-2022 |
| 减数分裂启动的分子机制 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2018-2021 |
| 固醇激素代谢机理及其在相关癌症诊治中的转化研究 | 基金委优青 | 2018-2020 |
| 肿瘤免疫学 | 基金委创新群体 | 2017-2022 |
| 肺组织生理病理动态转化的小鼠模型和类器官模型的构建及研究 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2017-2022 |
| 生理病理转化过程中蛋白质机器定量化及多组学数据测定 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2017-2022 |
| 蛋白质机器动态网络的临界理论和方法研究 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2017-2022 |
| 小 RNA-蛋白质机器在哺乳动物精子发生中的功能和机制 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2017-2022 |
| 细胞运动关键辅助蛋白复合物的结构、组装与功能 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2017-2022 |
| 着丝粒蛋白质机器调控细胞命运抉择的效应机制 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2017-2022 |
| 调控肝脏发育及大小的Hippo相关关键蛋白质机器的鉴定及其运行机制研究 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2017-2022 |
| 蛋白质机器在肺组织生理病理临界转化过程中的系统生物学研究 | 科技部国家重点研发计划项目 | 2017-2022 |
| RNA-蛋白质机器在哺乳动物遗传信息表达中的调控功能与机制 | 科技部国家重点研发计划项目 | 2017-2022 |
| 细胞运动关键蛋白质机器的结构与功能研究 | 科技部国家重点研发计划项目 | 2017-2022 |
| 免疫细胞多样性产生中蛋白质机器调控基因组稳定性的机制 | 科技部国家重点研发计划项目 | 2017-2022 |
| 器官体外制造 | 中科院战略性先导科技专项A类（项目） | 2017-2022 |
| 细胞增殖与分化 | 基金委杰青 | 2017-2021 |
| 心血管发育与组织再生 | 基金委杰青 | 2017-2021 |
| 乳腺干细胞的调控机理 | 基金委杰青 | 2017-2021 |
| 细胞外基质蛋白1基因缺失导致巨噬细胞过度活化而诱导自发性炎症性肠炎的机制研究 | 基金委重点 | 2017-2021 |
| 内胚层起源及内胚层细胞体内分化的调控机制 | 基金委重点 | 2017-2021 |
| 肝脏再生过程细胞可塑性的分子调控机制研究 | 基金委重点 | 2017-2021 |
| 发育中PRC1调控Hh信号通路Ci/Gli转录的分子机制及功能研究 | 基金委重点 | 2017-2021 |
| 中胚层谱系决定的转录调控机制 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2017-2021 |
| 内胚层谱系决定的转录调控机制 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2017-2021 |
| 中内胚层细胞分化过程中干细胞命运决定的转录调控 | 科技部国家重点研发计划项目 | 2017-2021 |
| PIWI/piRNA在哺乳动物精子形成及男性不育中的功能机制 | 基金委重大研究计划 | 2017-2020 |
| 基于“人造精子”技术的复杂疾病建模研究 | 上海市基础研究基金委重大项目 | 2017-2020 |
| 减数分裂分子基础和健康精子评估方法研究 | 上海市基础研究重大项目 | 2017-2020 |
| 血管稳态失衡中的细胞命运转变及调控机制研究 | 基金委重大研究计划 | 2017-2019 |
| 基于“人造精子”技术的重要基因标签研究 | 上海市生物医药重大项目 | 2017-2019 |
| Neddylation-CRL蛋白质机器调控肺损伤诱发的慢性炎性微环境变化及机制 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2016-2021 |
| 细胞命运可塑性的分子基础与调控 | 中科院战略性先导科技专项B类（专项） | 2016-2021 |
| 细胞分裂方式的可塑性调控 | 中科院战略性先导科技专项B类（项目） | 2016-2021 |
| 细胞增殖、分化与死亡的可塑性调控 | 中科院战略性先导科技专项B类（项目） | 2016-2021 |
| 应激条件下细胞可塑性调控 | 中科院战略性先导科技专项B类（项目 | 2016-2021 |
| 氨基酸诱导的mTORC1信号通路调控的分子机制研究 | 基金委重点 | 2016-2020 |
| NKT细胞分化成熟的调控机制 | 基金委重点 | 2016-2020 |
| T细胞抗原特异性免疫应答的调控机制 | 基金委重点 | 2016-2020 |
| YAP调控器官发育及稳态维持的分子机制研究 | 基金委重点 | 2016-2020 |
| 蛋白C受体对乳腺干细胞的作用及机制 | 基金委重点 | 2016-2020 |
| 孤雄单倍体胚胎干细胞携带CRISPR-Cas9文库用于筛选胚胎发育关键因子的研究 | 基金委重点 | 2016-2020 |
| Caprin-2在Wnt信号通路中的作用机制与生物学功能 | 基金委重点 | 2016-2020 |
| 染色体的结构与功能研究 | 基金委杰青 | 2016-2020 |
| 细胞黏附与迁移机理 | 基金委杰青 | 2016-2020 |
| 肿瘤与蛋白质稳态异常 | 基金委杰青 | 2016-2020 |
| 基于多种族2型糖尿病早期生物标记物发现及其指导的个体化疾病干预研究 | 基金委国际合作与交流项目 | 2016-2020 |
| 动物流感病毒免疫学研究 | 科技部国家重点研发计划课题主持 | 2016-2020 |
| 肝脏炎癌恶性转化关键节点的动态网络标志物模型及临床应用研究 | 基金委重大研究计划 | 2016-2018 |
| 染色质共价修饰在表观遗传调控中的机制研究（表观遗传学） | 基金委创新群体 | 2016-2018 |
| 抗肿瘤药物的个性化分层研究 | 中科院战略性先导科技专项A类（项目） | 2015-2020 |
| 关键理论和模型的研发与支撑 | 中科院战略性先导科技专项B类（项目） | 2015-2019 |
| 小分子介导的功能神经元的重建及在疾病模型中的应用 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2015-2019 |
| 基于编程和重编程的功能细胞的获取与应用研究 | 上海市基础研究重大项目 | 2015-2018 |
| 单倍体干细胞的建立、维持和应用 | 科技部重大科学研究计划项目 | 2014-2018 |
| 单倍体干细胞表观遗传特性维持的研究 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2014-2018 |
| 单倍体干细胞二倍体化的细胞周期相关机制研究 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2014-2018 |
| 单倍体干细胞的应用研究 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2014-2018 |
| 精子发生与成熟的表观遗传调控 | 科技部重大科学研究计划项目 | 2014-2018 |
| 精原干细胞命运决定的表观遗传调控 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2014-2018 |
| 圆形精子细胞变形的表观遗传调控 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2014-2018 |
| 精子成熟的表观遗传调控 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2014-2018 |
| 建立多能干细胞向中胚层细胞分化的体系并研究其调控机制 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2014-2018 |
| 多能干细胞分化所得中胚层细胞的功能鉴定 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2014-2018 |
| 遗传信息的解码与维护 | 中科院战略性先导科技专项B类（项目） | 2014-2018 |
| 超大分子复合体前沿技术 | 中科院战略性先导科技专项B类（项目） | 2014-2018 |
| 关键理论和模型的研发与支撑 | 中科院战略性先导科技专项B类（项目） | 2014-2018 |
| 适应性免疫的起源与演化 | 科技部973计划项目 | 2013-2017 |
| 抗原受体多样性的形成机制及其起源 | 科技部973计划课题主持 | 2013-2017 |
| 染色体结构与功能 | 科技部重大科学研究计划项目 | 2013-2017 |
| 蛋白质复合物调控染色体结构的分子机理 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2013-2017 |
| ncRNA调控染色体的分子机理 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2013-2017 |
| 端粒与染色体稳定性 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2013-2017 |
| 染色体调控异常与人类疾病 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2013-2017 |
| 干细胞标志分子的网络关联研究 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2013-2017 |
| 基于赖氨酸修饰相关的肿瘤治疗靶标鉴定及先导化合物的筛选 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2013-2017 |
| 神经元形态发生的调控机理 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2013-2017 |
| 炎症诱导肿瘤的分子调控网络研究 | 科技部重大科学研究计划项目 | 2012-2016 |
| 炎症诱导肿瘤的信号转导网络研究 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2012-2016 |
| 炎症诱导肿瘤中的miRNA调控网络研究 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2012-2016 |
| 炎症相关肿瘤中癌基因和抑癌基因的异常调控网络研究 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2012-2016 |
| 炎症诱导肿瘤中的免疫调控网络研究 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2012-2016 |
| 上皮组织的形成、更新及其调节机理 | 科技部重大科学研究计划项目 | 2012-2016 |
| 上皮组织干细胞的更新与分化 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2012-2016 |
| 纤毛化上皮细胞的分化与功能 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2012-2016 |
| 组蛋白甲基化修饰重要调控蛋白质的结构分析 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2012-2016 |
| 蛋白质生物合成的质量控制 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2012-2016 |
| 蛋白质错误折叠及分子伴侣的作用 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2012-2016 |
| MSC自我更新与分化的表观遗传学调控 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2012-2016 |
| 天然免疫应答相关蛋白的结构生物学研究 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2012-2016 |
| 代谢生理活动与病理过程中信号转导网络的系统生物学研究 | 科技部重大科学研究计划项目 | 2011-2015 |
| 基于BMP与GPCR等信号分子调控的代谢生理活动与病理过程的动态分子网络的定量化研究 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2011-2015 |
| 基于BMP与GPCR等信号分子调控的代谢生理活动与病理过程的动态分子网络的信息整合与分析 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2011-2015 |
| 细胞谱系的建立与发育调控 | 中科院战略性先导科技专项A类（项目） | 2011-2015 |
| 亚细胞代谢调控及其相关老年痴呆症等疾病机理 | 科技部重大科学研究计划项目 | 2011-2015 |
| 细胞质膜的脂质代谢调控与功能结构域 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2011-2015 |
| 内质网蛋白质代谢调控与应激信号通路 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2011-2015 |
| 基于上海同步辐射光源的结构生物学技术和方法研究 | 科技部重大科学研究计划项目 | 2011-2015 |
| 高效率、高精度和自动化的同步辐射数据收集、处理和结构解析系统的研究 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2011-2015 |
| 干细胞编程与重编程中表观遗传调控的分子机制和结构基础 | 科技部重大科学研究计划项目 | 2011-2015 |
| 干细胞编程与重编程中表观遗传密码建立和维持的分子机制和结构基础 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2011-2015 |
| GPCR信号转导网络在代谢生理活动与病理过程中的作用机制研究 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2011-2015 |
| Hh梯度形成和信号转导的调控机制 | 科技部重大科学研究计划课题主持 | 2011-2015 |
| 微RNA关键结合蛋白的功能与机制 | 科技部973计划课题主持 | 2011-2015 |
| 体细胞重编程微RNA功能及调控网络 | 科技部973计划课题主持 | 2011-2015 |
| 非编码RNA与蛋白质相互作用在干细胞命运决定过程中的调控网络 | 科技部973计划课题主持 | 2011-2015 |
| 炎症过程中细胞黏附的信号转导机制 | 科技部973课题主持 | 2010-2014 |
| 炎症过程中细胞极性形成的信号转导机制 | 科技部973课题主持 | 2010-2014 |
| 成形素诱导的信号转导通路的调控机制 | 科技部重大研究计划课题主持 | 2010-2014 |
| 细胞生长过程细胞骨架可塑性的调控机制 | 科技部重大研究计划课题主持 | 2010-2014 |
| 人细胞质氨基酰-trNA 合成酶的研究 | 基金委重点 | 2010-2013 |
| 神经元受体和离子通道轴浆运输的调控机制 | 基金委重点 | 2010-2013 |
| Wnt信号转导与调控的分子机制 | 基金委重点 | 2010-2013 |
| 精子在附睾成熟得分子机理的研究 | 基金委重点 | 2010-2013 |
| 免疫学 | 基金委杰青 | 2010-2013 |
| 生物化学 | 基金委杰青 | 2010-2013 |
| 细胞生长调控的重要蛋白质群的功能与作用机制 | 科技部重大科学研究计划项目 | 2009-2014 |
| 脂质代谢关键蛋白质的功能与调控机制 | 科技部重大研究计划首席科学家 | 2009-2013 |
| 诱导多能干细胞（iPS）的重编程机制 | 科技部重大研究计划首席科学家 | 2009-2013 |
| 脂质合成与吸收的关键膜蛋白及其复合物 | 科技部重大研究计划课题主持 | 2009-2013 |
| iPS重编程过程中的表观遗传学调控作用 | 科技部重大研究计划课题主持 | 2009-2013 |
| 组蛋白H4的K5/8/12乙酰化“密码”的建立及解读 | 基金委重大研究计划 | 2009-2012 |
| 新的组蛋白去甲基化酶的鉴定及其生物学功能研究 | 基金委重大研究计划 | 2009-2012 |
| 模拟人体内环境研究白念珠菌形态转变的分子机制 | 基金委重点 | 2009-2012 |
| BMP信号在中枢神经系统发育过程中作用机制研究 | 基金委重点 | 2009-2012 |
| Nudel\Lis1\Dynein通路调节细胞骨架的组织和功能的机制 | 基金委重点 | 2009-2012 |
| 建立基于绵羊诱导性多能干细胞（iPS细胞）的基因定点整合和敲除的转基因操作关键技术 | 农业部重大专项 | 2009-2010 |
| δ阿片受体拮抗剂作为抗老年痴呆症新药的研究 | 卫生部重大专项 | 2009-2010 |
| Robo1-Fc重组蛋白治疗肿瘤生长和转移的临床前研究 | 卫生部重大专项 | 2009-2010 |
| 新的端粒酶抑制蛋白LPTS的抗肿瘤药效研究 | 卫生部重大专项 | 2009-2010 |
| 重组端粒酶抑制蛋白LPTS的制备和抗肿瘤药效研究 | 中科院重要方向项目 | 2009-2010 |
| 战胜癌症的新策略和新方法 | 中科院重要方向项目 | 2009-2010 |
| 建立猪诱导多能干细胞系（iPS）进而建立猪胚胎干细胞系（ESC）的研究 | 中科院重要方向项目 | 2009-2010 |
| 表观遗传网络和BMP信号调控胚胎干细胞神经分化的分子机制 | 中科院重要方向项目 | 2009-2010 |
| 核移植与iPS技术诱导体细胞重编程的比较研究 | 中科院重要方向项目 | 2009-2010 |
| 纺锤体基质蛋白质在胚胎干细胞维持和分化中的功能 | 中科院重要方向项目 | 2009-2010 |
| 体外诱导鼠尾纤维细胞转分化为肝细胞的研究 | 中科院重要方向项目 | 2009-2010 |
| 应激反应导致认知障碍的分子生物学基础 | 中科院重要方向项目 | 2009-2010 |
| 化学小分子对于G蛋白偶联受体介导的蛋白-蛋白相互作用影响的研究 | 基金委重大研究计划 | 2008-2011 |
| 上皮细胞转分化与凋亡命运的选择及其调控机理 | 基金委重点 | 2008-2011 |
| 参与组蛋白修饰的重要蛋白质和蛋白质复合物的结构与功能研究 | 基金委重点 | 2008-2011 |
| 细胞极性影响细胞增殖、迁移和肿瘤发生发展的机理 | 基金委重点 | 2008-2011 |
| DNA甲基转移酶复合物在胚胎发育表观遗传调控中的作用及其机制 | 基金委重点 | 2008-2011 |
| 新型原子力显微镜和微型光镊的研发与应用 | 中科院重要方向项目 | 2008-2011 |
| 蛋白质复合物动态变化的分子机制与功能 | 科技部重大研究计划项目 | 2007-2011 |
| 胚胎干细胞定向分化过程中关键科学问题的研究 | 科技部重大研究计划项目 | 2007-2011 |
| 功能性T细胞亚群的免疫调节及其相关机制的研究 | 科技部973课题主持 | 2007-2011 |
| 原始免疫重排机理和形成机制及其比较免疫学研究 | 科技部973课题主持 | 2007-2011 |
| 蛋白质复合物的动态转运 | 科技部重大研究计划课题主持 | 2007-2011 |
| 蛋白质复合物的动态网络 | 科技部重大研究计划课题主持 | 2007-2011 |
| 研究转录因子及转录辅助因子（Co-factors）在胚胎干细胞定向分化中的作用 | 科技部重大研究计划课题主持 | 2007-2011 |
| 研究由胚胎干细胞来源的分化细胞在动物体内的功能 | 科技部重大研究计划课题主持 | 2007-2011 |
| 利用光反射差系统开展附睾中miRNA的生物功能及作用机制研究 | 科技部重大研究计划课题主持 | 2007-2011 |
| 参与基因表达调控的蛋白质及蛋白质复合物的结构与功能研究 | 科技部重大研究计划课题主持 | 2007-2011 |
| 胚胎早期发育关键环节的生物学基础 | 科技部重大研究计划课题主持 | 2007-2011 |
| 功能特异性细胞发育的调控机理 | 科技部重大研究计划课题主持 | 2007-2011 |
| 中科院干细胞库及干细胞基因操作技术平台 | 科技部重大研究计划课题主持 | 2007-2011 |
| 癌症的靶向基因-病毒治疗产品的研发 | 科技部863重点 | 2007-2010 |
| V(D)J重组关键调控基因的筛选与功能作用 | 科技部863专题 | 2007-2010 |
| 端粒酶亚基及端粒结合蛋白复合体Cdc13p/Stn1p/Ten1p, Ku70/80在端粒DNA复制中的作用 | 基金委重点 | 2007-2010 |
| P-选凝素参与的信号转导对白细胞黏附和迁移运动的调节 | 基金委重点 | 2007-2010 |
| 分子生物学国家重点实验室 | 基金委重点 | 2007-2010 |
| 中科院分子细胞生物学重点实验室 | 基金委重点 | 2007-2010 |
| G蛋白偶联受体调节基因转录和细胞功能的表观遗传机制 | 基金委杰青 | 2007-2010 |
| 抗2型糖尿病候选新药和干预新方法的系统性研究 | 中科院重大项目 | 2007-2010 |
| 海洋生物多肽毒素及活性多肽的基础研究与药物应用 | 中科院重要方向项目 | 2007-2010 |
| Wnt和BMP信号通路在脊椎动物胚胎体轴形成及神经分化过程中的功能及其相互作用机理 | 中科院重要方向项目 | 2007-2010 |
| 细胞活动过程中的动态蛋白质组研究 | 中科院重要方向项目 | 2007-2010 |
| 真核基因转录调控中重要蛋白质复合物的结构与功能研究 | 中科院重要方向项目 | 2007-2010 |
| 细胞极性（polarity）影响细胞增殖和肿瘤发生的机制 | 中科院重要方向项目 | 2007-2010 |
| 胆固醇代谢平衡调控及相关代谢性疾病的分子机理 | 中科院重要方向项目 | 2007-2010 |
| 核移植诱导体细胞重编程的研究 | 中科院重要方向项目 | 2007-2010 |
| 2型糖尿病发生发展机制的研究 | 科技部973首席科学家 | 2006-2011 |
| 细胞命运决定的分子网络 | 基金委创新群体 | 2006-2011 |
| 胚胎干细胞全能性关键分子的调控机制 | 科技部重大研究计划课题主持 | 2006-2011 |
| 多潜能干细胞向器官原基干细胞分化的信号调控网络 | 科技部重大研究计划课题主持 | 2006-2011 |
| 胆固醇代谢平衡调控及其相关重要疾病的代谢组学机理 | 科技部重大研究计划课题主持 | 2006-2011 |
| 精子功能的基础与临床研究 | 科技部重大研究计划课题主持 | 2006-2011 |
| 干细胞命运决定的分子调控网络 | 科技部重大研究计划首席科学家 | 2006-2011 |
| 蛋白质的错误折叠和聚集 | 科技部重大研究计划课题主持 | 2006-2011 |
| 2型糖尿病发生过程中的分子网络与作用机制研究 | 科技部973课题主持 | 2006-2011 |
| 抗心脑血管凝血，抗炎及抗病毒感染单抗药物的研制及应用 | 科技部863重大 | 2006-2010 |
| 神经变性病的神经元选择性变性的机制 | 科技部973课题主持 | 2006-2010 |
| 辅助性T细胞分化的分子机制的研究 | 基金委重点 | 2006-2009 |
| 七次跨膜受体介导的信号转导与调控的分子网络 | 中科院重要方向项目 | 2006-2009 |
| 胚胎干细胞向肝细胞、神经细胞分化的调控机制研究 | 中科院重要方向项目 | 2006-2009 |
| 精子成熟的分子基础及临床应用 | 中科院重要方向项目 | 2006-2009 |
| 细胞迁移在炎症、血栓和肿瘤中的作用 | 中科院重要方向项目 | 2006-2009 |
| 禽流感病毒与宿主细胞相互作用的分子机理研究 | 中科院重要方向项目 | 2006-2009 |
| 非编码RNA结构与功能及其介导基因表达调控的作用机理研究 | 中科院重要方向项目 | 2006-2009 |
| 前列腺癌干细胞的分离鉴定及靶向基因治疗 | 中科院重要方向项目 | 2006-2009 |
| 癌症的靶向基因治疗研究 | 中科院重要方向项目 | 2006-2009 |
| I型糖尿病和缺血性器官损伤(心肌梗塞、肾移植)防治的新靶点及其分子机制 | 中科院重要方向项目 | 2006-2009 |
| 组织工程化组织形成与转归机制 | 科技部973课题主持 | 2005-2011 |
| 肿瘤和神经系统疾病的表观遗传机制 | 科技部973项目 | 2005-2010 |
| DNA甲基化谱式的建立与维持 | 科技部973课题主持 | 2005-2010 |
| 染色质结构与功能 | 科技部973课题主持 | 2005-2010 |
| 细胞信号转导对表观遗传网络的调节作用 | 科技部973课题主持 | 2005-2010 |
| miRNA在细胞分化和心血管病中的作用 | 科技部973课题主持 | 2005-2010 |
| 小分子非编码RNA与蛋白质相互作用的分子基础及机制 | 科技部973课题主持 | 2005-2010 |
| 细胞分化和定向迁移的分子调节机制 | 基金委创新群体 | 2005-2010 |
| 细胞信号转导及反馈调控 | 基金委创新群体 | 2001-2009 |
