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  • 韩硕
  • 研究员,研究组长,博士生导师
  • E-mail: shuohan@sibcb.ac.cn
  • 实验室主页: https://hanshuolab.com/
    个人简介:
  •   2014年毕业于清华大学,获化学生物学学士学位和计算机科学辅修学位;2014年9月至2020年1月先后就读于美国麻省理工学院和斯坦福大学,获化学生物学博士学位;2020年2月至2022年12月,获得Damon Runyon Foundation Fellowship,于美国斯坦福大学干细胞与再生医学研究所从事博士后研究;2023年1月起任中科院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)研究员,研究组长,博士生导师

    社会任职:
    研究方向:
  • 空间多组学与干细胞调控
    研究工作:
  •   上皮干细胞作为屏障组织(例如皮肤、肺、肠、膀胱)中细胞更新的来源,在组织稳态、损伤/修复、衰老以及癌症中发挥关键作用。了解决定这些细胞命运的复杂调控网络和动态信号转导需要具有高时空分辨率的系统性工具。我们实验室致力于发展新型生物大分子标记技术,并用于系统测绘上皮干细胞分子组成、干细胞与微环境相互作用,以及在组织再生和疾病发展过程中这些分子图谱的动态变化。

      我们的研究交叉融合了化学生物学和干细胞生物学两个领域,涉及包括蛋白质工程、小分子探针设计、蛋白质组学、高通量测序、单细胞转录组学、荧光成像、转基因小鼠模型、类器官、谱系追踪和机器学习等在内的一系列手段,聚焦以下两个相辅相成的研究方向:

      1. 基于分子标记技术的空间多组学方法

      2. 调控上皮干细胞命运与功能的分子机理

    承担科研项目情况:
    代表论著:
    1. S. Han*, B. Zhao*, S. A. Myers, S. A. Carr, C. He, and A. Y. Ting. 2020. RNA-protein interaction mapping via MS2- or Cas13-based APEX targeting. PNAS, 117, 22068-22079. (* Co-first author)
    2. J. Li*, S. Han*, H. Li, N. D. Udeshi, T. Svinkina, D. R. Mani, C. Xu, R. Guajardo, Q. Xie, T. Li, D. J. Luginbuhl, B. Wu, C. N. McLaughlin, A. Xie, P. Kaewsapsak, S. R. Quake, S. A. Carr, A. Y. Ting, and L. Luo. 2020. Cell-surface proteomic profiling in the fly brain uncovers wiring regulators. Cell, 180, 373-386. (* Co-first author)
    3. F. Fazal*, S. Han*, K. R. Parker, P. Kaewsapsak, J. Xu, A. N. Boettiger, H. Y. Chang, and A. Y. Ting. 2019. Atlas of subcellular RNA localization revealed by APEX-seq. Cell, 178, 473-490. (* Co-first author)
    4. S. Han*, J. Li*, and A. Y. Ting. 2018. Proximity labeling: spatially resolved proteomic mapping for neurobiology. Curr. Opin. Neurobiol., 50, 17-23. (* Co-first author)
    5. S. Han, N. D. Udeshi, T. J. Deerinck, T. Svinkina, M. H. Ellisman, S. A. Carr, and A. Y. Ting. 2017. Proximity biotinylation as a method for mapping proteins associated with mtDNA in living cells. Cell Chem. Biol., 24, 404-414.
    6. Q. Xie, J. Li, H. Li, N. D. Udeshi, T. Svinkina, D. Orlin, S. Kohani, R. Guajardo, D.R. Mani, C. Xu, T. Li, S. Han, W. Wei, S. A. Shuster, D. J. Luginbuhl, S. R. Quake, S. E. Murthy, A. Y. Ting, S. A. Carr, and L. Luo. 2022. Transcription factor Acj6 controls dendrite targeting via a combinatorial cell-surface code. Neuron, 110, 2299-2314.
    7. S. A. Shuster, J. Li, U.R. Chon, M. C. Sinantha-Hu, D. J. Luginbuhl, N. D. Udeshi, D. K. Carey, Y. H. Takeo, Q. Xie, C. Xu, D.R. Mani, S. Han, A. Y. Ting, S. A. Carr, and L. Luo. 2022 In situ cell-type-specific cell-surface proteomic profiling in mice. Neuron, 110, 3882-3896.
    8. Y. Zhang, W. Lu, D. P. Bulkley, J. Liang, A. Ralko, S. Han, K. J. Roberts, A. Li, W. Cho, Y. Cheng, A. Manglik, and P. A. Beachy. 2020. Hedgehog pathway activation through nanobody-mediated conformational blockade of the Patched sterol conduit. PNAS, 117, 28838-28846.
    9. R. Guajardo, D. J. Luginbuhl, S. Han, L. Luo, and J. Li. 2019. Functional divergence of Plexin B structural motifs in distinct steps of Drosophila olfactory circuit assembly. Elife, 8, e48594.
    10. O. O. Abudayyeh, J. S. Gootenberg, P. Essletzbichler, S. Han, J. Joung, J. J. Belanto, V. Verdine, D. B. T. Cox, M. J. Kellner, A. Regev, E. S. Lander, D. F. Voytas, A. Y. Ting, and F. Zhang. 2017. RNA targeting with CRISPR-Cas13. Nature, 550, 280-284.
    11. T. C. Branon, S. Han, and A. Y. Ting. 2017. Beyond immunoprecipitation: exploring new interaction spaces with proximity biotinylation. Biochemistry, 56, 3297-3298.
    12. Z. Wei, S. Han, X. Gong, Y. Zhao, C. Yang, S. Zhang, and X. Zhang. 2013. Rapid removal of matrices from small-volume samples by step-voltage nanoelectrospray, Angew. Chem. Int. Ed., 52, 11025 – 11028.
    获奖及荣誉:
    研究组成员: