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  • 杨荟
  • 研究员,RNA介导的基因表达调控分子机制研究
  • E-mail: yanghui@sibcb.ac.cn
  • 实验室主页: 
    个人简介:
  •   2008年毕业于南京大学,获得学士学位。

      2014年毕业于中国科学院生物化学与细胞生物学研究所,获得博士学位。

      2014年2月加入美国纪念斯隆-凯特琳癌症中心(Memorial Sloan Kettering Cancer Center)从事博士后研究,获2018 Tri-Institutional Breakout Prizes for Junior Investigators。

      2018年加入中国科学院生物化学与细胞生物学研究所,任研究员、研究组长、博士生导师。

    社会任职:
  •  
    研究方向:
  • RNA介导的基因表达调控分子机制研究
    研究工作:
  •   多细胞生物的基因表达调控是细胞分化、形态发生和个体发育的基础,调控的异常与多种疾病的发生发展密切相关。基因表达调控包括基因水平、转录水平、转录后水平、翻译水平和翻译后水平等多个层面、多种方式的综合调控。 细胞内存在多种类型的非编辑RNA(ncRNA),包括转运RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)、小RNA(如microRNA、siRNA、piRNA等)和长非编码RNA(lncRNA)。这些非编辑RNA及其与蛋白质组装成的复合物参与细胞的多种活动,包括基因的表达调控,并在多种疾病和肿瘤的发生、发展过程中发挥重要功能。基于非编码RNA产生RNAi和CRISPR技术等基因编辑技术,可以实现基因表达水平调控、定点突变和表观遗传修饰改变等等。CRISPR-Cas系统是存在于细菌和古细菌的获得性免疫系统,在RNA的介导下,利用多种不同的核酸内切酶序列特异性地靶向并切割DNA或者RNA分子,在构建细胞系模型、动植物模型、基因的定点编辑和遗传疾病治疗等方面有广泛的应用前景。

      我们实验室主要运用结构生物学方法,结合分子生物学和生物化学等其他技术手段,研究上述几个方面中相关的RNA-蛋白质复合物,在分子水平阐明其发挥功能的结构基础,有助于我们了解相关疾病的分子机理,为药物的研发以及疾病的治疗提供结构信息。未来五年,我们主要研究真核细胞中lncRNA与相关蛋白质或蛋白质复合物组装及其在基因表达调控中发挥作用的分子机理,以及CRISPR-Cas系统特异性识别并切割DNA或RNA分子的分子机理。

    承担科研项目情况:
    代表论著:
    1. Yang, H.#, and Patel, D.J.# A type III-E CRISPR Craspase exhibiting RNase and protease activities. Cell Res, 2022, 32:1044-6.
    2. Wang, B., Zhang, T., Yin, J., Yu, Y., Xu, W., Ding, J.#, Patel, D.J.#, and Yang, H.# Structural basis for self-cleavage prevention by tag:anti-tag pairing complementarity in type VI Cas13 CRISPR systems. Mol Cell, 2021, 81:1100-15 e1105.
    3. Wang B, Xu W, Yang H#. Structural basis of a Tn7-like transposase recruitment and DNA loading to CRISPR-Cas surveillance complex. Cell Res, 2020, 30:185-7.
    4. Yang H# and Patel DJ#. CasX: a new and small CRISPR gene-editing protein. Cell Res, 2019, 29:345-6. (# co-corresponding authors)
    5. Guo TW*, Bartesaghi A*, Yang H*, Falconieri V, Rao P, Merk A, Eng ET, Raczkowski AM, Fox T, Earl LA, Patel DJ & Subramaniam S. Cryo-EM structures reveal mechanism and inhibition of DNA targeting by a CRISPR-Cas surveillance complex. Cell, 2017, 171:414-426. (* co-first authors)
    6. Yang H# and Patel DJ#. Inhibition mechanism of an anti-CRISPR suppressor AcrIIA4. Mol Cell, 2017 67:117-127. (# co-corresponding authors)
    7. Yang H# and Patel DJ#. New CRISPR-Cas systems discovered. Cell Res, 2017, 27:313-4. (# co-corresponding authors)
    8. Yang H#, Gao P, Rajashankar KR, and Patel DJ#. PAM-dependent target DNA recognition and cleavage by C2c1 CRISPR-Cas endonuclease. Cell, 2016, 167:1814-28. (# co-corresponding authors)
    9. Gao P, Yang H, Rajashankar KR, Huang Z, and Patel DJ. Type V CRISPR-Cas Cpf1 endonuclease employs a unique mechanism for crRNA-mediated target DNA recognition. Cell Res, 2016, 26:901-13.
    10. Lee M, Choi Y, Kim K, Jin H, Lim J, Nguyen TA, Yang J, Jeong M, Giraldez AJ, Yang H, Patel DJ, and Kim VN. Adenylation of maternally inherited microRNAs by Wispy. Mol Cell, 2014, 56:696-707.
    11. Yang H, Zhang T, Tao Y, Wang F, Tong L, and Ding J. Structural insights into the functions of the FANCM-FAAP24 complex in DNA repair. Nucleic Acids Res, 2013, 41:10573-83.
    12. Li S, Du J, Yang H, Yin J, Ding J, and Zhong J. Functional and structural characterization of DNMT2 from Spodoptera frugiperda. J Mol Cell Biol, 2013, 5:64-6.
    13. Zhang T*, Péli-Gulli*, Yang H, De Virgilio C, and Ding J. Ego3 functions as a homodimer to mediate the interaction between Gtr1-Gtr2 and Ego1 in the EGO complex to activate TORC1. Structure, 2012, 20:2151-60.
    14. Yang H, Zhang T, Tao Y, Wu L, Li H, Zhou J, Zhong C, and Ding J. Saccharomyces cerevisiae MHF complex structurally resembles the histones (H3-H4)2 heterotetramer and functions as a heterotetramer. Structure, 2012, 20:364-70.
    15. Yang H*, Wang J*, Du J, Zhong C, Zhang D, Guo H, Guo Y and Ding J. Structural basis of immunosupperssion by the therapeutic antibody daclizumab. Cell Res, 2010, 20:1361-71. (* co-first authors)
    16. Du J, Yang H, Zhang D, Wang J, Guo H, Peng B, Guo Y and Ding J. Structural basis for the blockage of IL-2 signaling by therapeutic antibody daclizumab. J Immunol, 2010, 184:1361-8.
    17. Du J*, Yang H*, Peng B, and Ding J. Structural modeling and biochemical studies reveal insights into the molecular basis of the recognition of beta-2-microglobulin by antibody BBM.1. J Mol Recognit, 2009, 22:465-73. (* co-first authors)
    18. Du J, Yang H, Guo Y and Ding J. Structure of the Fab fragment of therapeutic antibody Ofatumumab provides insights into the recognition mechanism with CD20. Mol Immunol, 2009, 46:2419-23.
    19. Du J, Hou S, Zhong C, Lai Z, Yang H, Dai J, Zhang D, Wang H, Guo Y and Ding J. Molecular basis of recognition of human osteopontin by 23C3, a potential therapeutic antibody for treatment of rheumatoid arthritis. J Mol Biol, 2008, 382:835-42.
    获奖及荣誉:
    研究组成员: