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  • 林琳
  • 研究员,研究组长,博士生导师
  • E-mail: linlin@sibcb.ac.cn
  • 实验室主页: 
    个人简介:
  • 2011年毕业于中山大学,获生物技术专业学士学位。2016年毕业于新加坡国立大学,获得博士学位。2016年至2024年分别在哈佛大学医学院布莱根妇女医院和荷兰皇家艺术与科学院Hubrecht研究所接受博士后训练;拟于2024年7月起任中科院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)研究员,研究组长,博士生导师。

    社会任职:
    研究方向:
  • 细胞功能与组织稳态
    研究工作:
  • 多细胞生物展现出高度复杂的自我组织调控机制。细胞通过信号转导通路感知外界刺激,调控自身基因表达,从而决定细胞命运并维持其生物学功能;另一方面,细胞通过相互作用和信息传递协同合作,形成具有特定结构和功能的多细胞组织,细胞在空间和功能上呈现出精密有序的状态。深入研究其中的调控机制不仅对理解生物体的正常发育和功能维持至关重要,同时也为阐明疾病的致病机理提供重要线索。

    基于此背景,我们的研究重点聚焦于上皮组织的自我调控机制,探索上皮组织内不同细胞感知其复杂微环境并据此做出响应的分子机制。利用人类上皮组织来源的类器官模型进行发育和疾病的研究,深入探究上皮组织的生长发育、修复再生以及相关疾病的发生机理。我们的研究将通过整合类器官技术和基于 CRISPR/Cas9 的基因编辑筛选技术,综合运用发育生物学、细胞生物学、生物化学、分子生物学、生物信息学和显微光学成像等方法开展以下三个方向的科学研究:

    1. 在体外重现组织内细胞分化和功能,并解析触发细胞转变的内外源性信号。

    2. 揭示细胞间相互作用如何影响组织稳态,并研究这些相互作用在时间和空间上的动态特性,以及它们如何协调维护组织的正常生理功能。

    3. 探究特定细胞功能失调的致病机制,并探讨这种功能失调如何在组织层面上呈现,进而影响整个组织和器官的健康,为疾病诊断和治疗提供新的策略。


    承担科研项目情况:
    代表论著:
    1. L. Lin, and H. Clevers, Decoding endocrine cell differentiation: insights from high‐throughput CRISPR screening in human gut organoids. Clin. Transl. Med. 14. (2024). Invited Commentary
    2. L. Lin, J. DeMartino, D. Wang, G. J. F. van Son, R. van der Linden, H. Begthel, J. Korving, A. Andersson-Rolf, S. van den Brink, C. Lopez-Iglesias, W. J. van de Wetering, A. Balwierz, T. Margaritis, M. van de Wetering, P. J. Peters, J. Drost, J. H. van Es, H. Clevers, Unbiased transcription factor CRISPR screen identifies ZNF800 as master repressor of enteroendocrine differentiation. Science. 382, 451–458 (2023). First author; co-corresponding author
    3. G.-W. He#, L. Lin#, J. DeMartino, X. Zheng, N. Staliarova, T. Dayton, H. Begthel, W. J. van de Wetering, E. Bodewes, J. van Zon, S. Tans, C. Lopez-Iglesias, P. J. Peters, W. Wu, D. Kotlarz, C. Klein, T. Margaritis, F. Holstege, H. Clevers, Optimized human intestinal organoid model reveals interleukin-22-dependency of paneth cell formation. Cell Stem Cell. 29, 1333-1345.e6 (2022). #First authors; Equal contribution
    4. M. Velimirovic, L. C. Zanetti, M. W. Shen, J. D. Fife, L. Lin, M. Cha, E. Akinci, D. Barnum, T. Yu, R. I. Sherwood, Peptide fusion improves prime editing efficiency. Nat. Commun. 13, 3512 (2022). Co-author
    5. L. Lin, B. Holmes, M. W. Shen, D. Kammeron, N. Geijsen, D. K. Gifford, R. I. Sherwood, Comprehensive Mapping of Key Regulatory Networks that Drive Oncogene Expression. Cell Rep. 33, 108426 (2020). First author
    6. E. Akinci#, M. Cha#, L. Lin#, G. Yeo#, M. C. Hamilton, C. J. Donahue, H. C. Bermudez-Cabrera, L. C. Zanetti, M. Chen, S. A. Barkal, B. Khowpinitchai, N. Chu, M. Velimirovic, R. Jodhani, J. D. Fife, M. Sovrovic, P. A. Cole, R. A. Davey, C. A. Cassa, R. I. Sherwood, Elucidation of remdesivir cytotoxicity pathways through genome-wide CRISPR-Cas9 screening and transcriptomics. bioRxiv  Prepr. Serv. Biol. (2020), doi:10.1101/2020.08.27.270819. #First authors; Equal contribution
    7. G. H. T. Yeo, L. Lin, C. Y. Qi, M. Cha, D. K. Gifford, R. I. Sherwood, A Multiplexed Barcodelet Single-Cell RNA-Seq Approach Elucidates Combinatorial Signaling Pathways that Drive ESC Differentiation. Cell Stem Cell. 26, 938-950.e6 (2020). Co-author
    8. L. Lin, J. Göke, E. Cukuroglu, M. R. Dranias, A. M. J. VanDongen, L. W. Stanton, Molecular Features Underlying Neurodegeneration Identified through In Vitro Modeling of Genetically Diverse Parkinson’s Disease Patients. Cell Rep. 15, 2411–2426 (2016). First author
    9. Z. C. Chen, W. Zhang, L. L. Chua, C. Chai, R. Li, L. Lin, Z. Cao, D. C. Angeles, L. W. Stanton, J. H. Peng, Z. D. Zhou, K. L. Lim, L. Zeng, E. K. Tan, Phosphorylation of amyloid precursor protein by mutant LRRK2 promotes AICD activity and neurotoxicity in Parkinson’s disease. Sci. Signal. 10, 1–12 (2017). Co-author
    10. S. Y. Ng, L. Lin, B. S. Soh, L. W. Stanton, Long noncoding RNAs in development and disease of the central nervous system. Trends Genet. 29, 461–468 (2013). Co-author
    获奖及荣誉:
    研究组成员: