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  • 任捷
  • 研究员,研究组长,博士生导师
  • E-mail: jie.ren@sibcb.ac.cn
  • 实验室主页: 
    个人简介:
  • 2004年毕业于南京大学,2010年于美国纽约州立大学石溪分校获得博士学位,随后在冷泉港实验室从事博士后研究。2018年12月回国任中国科学院北京基因组研究所研究员,2025年1月加入中国科学院分子细胞科学卓越创新中心。

    长期从事RNA与染色质动态调控前沿研究,系列原创性成果以第一或通讯(含共同)作者身份发表在Cell(2篇)、NatureCell Stem Cell(3篇)、Molecular Cell(2篇)、Cell Research等期刊上,累计影响因子逾900,被引超2000次,其中影响因子大于20的论文12篇。课题组历年承担了国家重点研发计划(3项)、国家自然科学基金面上项目(2项)、中国科学院战略性先导科技专项(A类2项、B类1项)等多项重大科研任务。

    现任中国生物化学与分子生物学会核糖核酸专业分会委员、中国老年学和老年医学学会抗衰老分会委员、中国生物信息学学会(筹) 非编码RNA 与RNA 信息学专业委员会委员等学术职务,并担任ExRNA杂志编委。

    社会任职:
    研究方向:
  • RNA动态调控在维持细胞与基因组稳态中的作用与机制
    研究工作:
  • 实验室长期聚焦于RNA如何调控染色质动态以维持基因组稳定性这一核心命题,致力于在“空间维度” 上解析生命信息调控的统一规律。我们以“转录-复制冲突” 这一导致基因组不稳定、衰老及肿瘤的关键事件为突破点,系统揭示了R-loop、RNA修饰(如m6A)及RNA结合蛋白(如DDX21、Dcr1)等在协调转录终止、修复通路选择中的关键作用,为理解干细胞命运、衰老、肿瘤发生等过程中(表观)基因组失稳的根源提供了新机制(Mol Cell, Cell Res)。基于在染色质层面的深刻理解,我们的研究视野正拓展至更广阔的细胞空间维度。我们致力于探索:RNA介导的调控逻辑,是否并如何统一作用于染色质与无膜细胞器等关键亚细胞结构,以协同维持细胞稳态?通过整合前沿的遗传学、单细胞多组学(Annu. Rev. Biomed. Data Sci.)与干预策略(Cell Stem Cell, Nat Aging),我们最终旨在阐明从(表观)基因组完整性到细胞功能衰退的全程调控网络,揭示跨尺度、跨结构的生命调控共性机制,为肿瘤、免疫、神经及衰老相关疾病的防治提供新靶点与新策略。

    课题组研究方向主要包括:

    1. 转录-复制冲突与基因组稳定性的表观遗传机制:解析RNA及染色质修饰如何调控转录-复制碰撞,维护基因组完整性,并探索其靶向策略在癌症等疾病中的精准医学应用前景。
    2. RNA调控与细胞命运决定:研究RNA介导的跨染色质与亚细胞结构的调控网络如何影响干细胞稳态、衰老及分化,揭示其在发育与退行性疾病中的作用。
    3. 前沿技术开发与多维组学整合:建立并应用单细胞多组学、长读长测序等新型技术体系,在单细胞与亚细胞空间维度解析(表观)基因组功能与动态调控。

    实验室文化

    我们致力于营造一个开放、协作、充满探索精神的科研环境,尊重并全力支持每位成员的独立思考和科研志趣。我们珍视对科学本质的好奇心,鼓励学科交叉与技术创新,并为学生和博士后提供全面的科研训练与职业发展支持。我们诚挚欢迎对RNA生物学、表观遗传学、基因组学或细胞命运调控抱有热忱的青年才俊加入(专业背景不限,生物学、医学、化学、数学、计算机等皆宜),共同探索生命科学的未知前沿。

    承担科研项目情况:
    代表论著:
    1. Z. H. Wang, Y. Z. Zhang, T. Guo, M. He, Y. Y. Xu, S. Bhattacharjee, R. Martienssen*, J. Ren*. Dcr1 senses R-loops for RNAPII termination at sites of replication stress and repair pathway choice. Mol. Cell., 85(21):3947-3964.e10 (2025). Lead contact.
    2. M. Y. Zhu, Y. Z. Zhang, T. Guo, J. Ren*. Nascent RNA at the crossroad of transcription and replication. Trends Genet., 41(12):1109-1130 (2025). Corresponding author.
    3. J. Hao, Q. L. Liu, M. Liu, et al., Y. G. Yang*, J. Ren*. DDX21 mediates co-transcriptional RNA m6A modification to promote transcription termination and genome stability. Mol. Cell, 84(9):1711-1726.e11 (2024). Lead contact.
    4. R. Wu, F. Sun, W. Zhang*, J. Ren*, G. H. Liu*. Targeting aging and age-related diseases with vaccines. Nat. Aging, 4(4):464-482 (2024). Co-corresponding author.
    5. Y. Jing#, X. Jiang#, Q. Ji, Z. Wu, W. Wang, Z. Liu, P. Guillen-Garcia, C. R. Eseban, P. Ready, S. Horvath, J. Li, L. Geng, Q. Hu, S. Wang, J. C. I. Belmonte, J. Ren*, W. Zhang*, J. Qu*, G. H. Liu*. Genome-wide CRISPR activation screening in senescent cells reveals SOX5 as a driver and therapeutic target of rejuvenation. Cell Stem Cell., 30(11):1452-1471.e10 (2023). Co-corresponding author.
    6. J. Ren#, M. Song#, W. Zhang#, J. P. Cai, F. Cao, Z. Cao, P. Chan, C. Chen, G. Chen, H. Z. Chen, J. Chen, X. C. Chen, W. Ci, B. S. Ding, Q. Ding, F. Gao, S. Gao, J. D. Han, Q. Y. He, K. Huang, Z. Ju, Q. P. Kong, J. Li, J. Li, J. Li, X. Li, B. Liu, F. Liu, J. P. Liu, L. Liu, Q. Liu, Q. Liu, X. Liu, Y. Liu, X. Luo, S. Ma,  X. Ma, Z. Mao, J. Nie, Y. Peng, J. Qu, R. Ren, W. Song, S. Zhou,  L. Sun, Y. E. Sun, Y. Sun, M. Tian, X. L. Tian, Y. Tian, J. Wang, S. Wang, S. Wang, W. Wang, X. Wang, X. Wang, Y. J. Wang, Y. Wang, C. Wong, A. P. Xiang, Y. Xiao, Z. X. Xiao, Z. Xie, W. Xiong, D. Xu, Z. Yang, J. Ye, W. Yu, R. Yue, C. Zhang, H. Zhang, L. Zhang, X. Zhang, Y. Zhang, Y. W. Zhang, Z. Zhang, T. Zhao, Y. Zhao, T. Zhao, Y. Zhao, Z. Zhou, D. Zhu, W. Zou, G. Pei, G. H. Liu*. The Aging Biomarker Consortium represents a new era for aging research in China. Nat. Med., 29(9):2162-2165 (2023). Co-first author.
    7. S. Ma#, X. Chi#, Y. Cai#, Z. Ji#, S. Wang*, J. Ren*, G. H. Liu*. Decoding Aging Hallmarks at the Single-Cell Level. Annu. Rev. Biomed. Data Sci., 6:129-152 (2023). Co-corresponding author.
    8. M. He, X. Chi, J. Ren*. Applications of Oxford Nanopore Sequencing in Schizosaccharomyces pombe. Methods Mol. Biol., 2196: 97-116 (2021). Corresponding author.
    9. X. Yang#, Q. L. Liu#, W. Xu#, Y. C. Zhang#, Y. Yang, L. F. Ju, J. Chen, Y. S. Chen, K. Li, J. Ren*, Q. W. Sun*, Y. G. Yang*. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Res., 29(12):1035-1038 (2019). Co-corresponding author.
    获奖及荣誉:
    研究组成员: