11月12日，第34期王应睐讲座邀请了美国国家科学院院士、美国艺术与科学学院院士、美国发明家学院院士William (Bill) DeGrado教授主讲，作题为“De Novo Protein Design of Functional Proteins”的报告。本期王应睐讲座由张少庆研究员主持。
William (Bill) DeGrado专注于小分子、多肽和蛋白质的设计，致力于解决生物学机制问题。报告中，DeGrado重点介绍了小分子结合蛋白的设计流程。首先通过参数化设计或生成式AI得到初步的蛋白结构；相应的结构通过Rosetta，LigandMPNN等工具优化序列；得到的序列将再次使用Alphafold，ESMfold，Raptor-X-Single等AI工具预测结构。对于蛋白质-小分子复合物的情形，研究者将使用Glide，Autodock，CHAI-1等工具进行分子对接，并最后通过Amber，OpenMM等工具进行分子动力学模拟，筛选具有实验验证价值的候选蛋白，这些蛋白还可以进一步定向优化，以捕获计算无法察觉的特征。除小分子结合蛋白以外，DeGrado还提及了能够优化纳米孔测序效果的新蛋白，展现了蛋白质设计领域的多样性。讲座受到中心师生的关注，大家与DeGrado积极互动，踊跃参与讨论，现场气氛热烈。讲座结束后中心所务委员陈剑峰研究员为William (Bill) DeGrado教授颁发了王应睐讲座荣誉证书。
William (Bill) DeGrado是加利福尼亚大学旧金山分校药物化学系Toby Herfindal Presidential创业与创新教授和Pliant Therapeutics公司科学联合创始人。作为蛋白质设计的先驱，他创造了"蛋白质从头设计"这一术语。
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