可调控RNA聚合酶I转录,为肿瘤靶向治疗提供新靶标
人民网上海5月5日电 (记者姜泓冰) 国际著名学术期刊《细胞》(Cell)杂志今天发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组关于长非编码RNA的最新研究成果。该成果首次在人类细胞中发现可以调控RNA聚合酶I转录的全新长非编码RNA SLERT,并揭示了它在RNA聚合酶I转录过程中的重要功能和作用机制。
曾一度被认为是人类基因“暗物质”的长非编码RNA,其家族中不少成员已被证明广泛参与各种重要生命活动的调控。这次,陈玲玲研究组运用前期创建的无poly(A)尾巴RNA分离和测序技术发现了一条全新的长非编码RNA,还一并阐释了此RNA与众不同的功能,拓展了长非编码RNA的作用机制。
细胞核仁位于细胞核中,是RNA聚合酶I转录核糖体RNA (rRNA) 以及rRNA加工的重要场所。rRNA转录是将核糖体DNA (rDNA) 转变成rRNA的过程。作为细胞内含量最多的一类RNA,rRNA的转录失调与疾病发生密切关联,转录不足易导致骨髓衰竭性贫血,转录过多则易引发多种癌症。
这次发现的全新长非编码RNA被命名为SLERT。研究人员利用基因编缉技术精确敲除位于细胞核仁中的SLERT后发现,其缺失导致了RNA聚合酶I转录活性的降低。存在于细胞核仁中的RNA解旋酶DDX21围绕RNA聚合酶I形成直径约为400nm的环状结构,这个环状结构将RNA聚合酶I“围困”在其中,其“包围圈”大小直接影响RNA聚合酶I转录的活性。进一步研究表明,SLERT可以与DDX21结合改变DDX21的蛋白构象,从而调整DDX21环的大小。SLERT缺失会让环变小导致RNA聚合酶I的功能发挥受到阻碍,反之当环变大时就可以解除DDX21环对RNA聚合酶I的抑制。
人体细胞中含有约400个拷贝的核糖体DNA (rDNA) 序列,但仅有一半可以转变成rRNA,导致这种rRNA转录差异的原因是什么?陈玲玲研究组对于SLERT的研究也就此提出了一种新的机制,即通过SLERT-DDX21环对RNA聚合酶I转录调控进而控制rRNA转录差异。
研究人员还发现敲除,SLERT可以抑制模型小鼠体内的肿瘤生长速度,注入敲除SLERT的肿瘤细胞到小鼠,其体内肿瘤的生长速度要低于注入普通肿瘤细胞的小鼠,这为相关肿瘤的靶向治疗提供了新的靶标。该研究以崭新的视角揭示了RNA聚合酶I转录的新机制,也为深入研究细胞核仁结构及功能提供了新方向。
该工作在陈玲玲研究员的指导下,主要由生化与细胞所博士研究生邢宇航、姚润文和张杨共同完成。该研究还得到中科院-马普计算生物学所杨力研究员的大力帮助,以及植物生理生态所细胞分析技术平台、生化与细胞所细胞分析技术平台和动物实验技术平台的大力支持。经费支持来自科技部、基金委和中科院。
原载于2017年5月5日人民网上海频道