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  • 柳欣
  • 研究员,研究组长,博士生导师
  • E-mail: xin.liu@@sibcb.ac.cn
  • 实验室主页: 
    个人简介:
  •   2004年本科毕业于华中科技大学;2007年获得华中科技大学硕士学位;2013年于德克萨斯大学奥斯汀分校获得博士学位;2013-2019期间在MD安德森癌症中心和德克萨斯大学西南医学中心从事博士后研究;2019年起任中科院上海生化与细胞所研究员、研究组长。

    社会任职:
  •  
    研究方向:
  • 基因表达调控与功能基因组学
    研究工作:
  • 本研究组结合多组学分析,基因编辑,表观遗传干预,活细胞成像,分子生物学及生物化学等技术手段,研究细胞命运决定过程的基因转录调控环路,以及调控异常对疾病发生发展的影响。这些研究不仅有利于我们深入理解多细胞器官和个体发育的分子机制,也为治疗发育畸形、癌症等疾病及组织器官再生提供潜在靶点。

    多细胞生物体中不同细胞的命运和功能是由特异的基因表达程序决定。细胞命运决定的调控机制一直是生命科学领域中的一个基本问题。人类基因组计划发现用于存储蛋白质编码信息的区域仅占基因组的很小一部分,而基因组中存在大量调控基因转录的非编码序列,其中包括许多顺式调控元件(Cis-Regulatory Element, CRE), 例如,增强子、启动子、绝缘子等。这些顺式调控元件作为整合内、外源信息的平台,结合特定RNA、转录因子和表观调控蛋白,形成特异的染色质空间结构,精确调控基因表达程序进而决定细胞命运。本实验室主要研究方向集中在非编码调控元件的功能和动态调控机制上。具体研究内容包括:

      1. 顺式调控因子及染色质空间结构调控基因转录的分子机制

      2. 干细胞命运决定过程中的表观遗传调控

      3. 癌症等重大疾病的相关转录调控机理

    承担科研项目情况:
    代表论著:
    1. Vo LT, Kinney MA, Liu X, Zhang Y, Barragan J, Sousa PM, Jha DK, Han A, Cesana M, Shao Z, North TE, Orkin SH, Doulatov S, Xu J & Daley GQ, Regulation of embryonic haematopoietic multipotency by EZH1. Nature. 2018 Jan 25;553(7689):506-510.
    2. Liu X*, Zhang Y*, Chen Y*, Li M*, Zhou F*, Li K, Cao H, Ni M, Liu Y, Gu Z, Dickerson KE, Xie S, Hon GC, Xuan Z, Zhang MQ, Shao Z, Xu J. In Situ Capture of Chromatin Interactions by Biotinylated dCas9. Cell. 2017; 170(5):1028-1043.e19
    3. Liu X*, Zhang Y*, Ni M*, Hui Cao, Signer RA, Li D, Gu Z, Hu Z, Chandel NS, DeBerardinis RJ, Zhou F, Shao Z, Xu J. Regulation of mitochondrial biogenesis in erythropoiesis by mTORC1-mediated protein translation. Nature Cell Biology. 2017; 19(6):626-638
    4. Huang J*, Liu X*, Li D*, Shao Z*, Cao H, Zhang Y, Trompouki E, Bowman TV, Zon LI, Yuan GC, Orkin SH, Xu J. Dynamic Control of Enhancer Repertoires Drives Lineage and Stage-Specific Transcription during Hematopoiesis. Dev Cell. 2016; 36(1):9-23.
    5. Qin JC*, Liu X*, Baffin B, Chen X, Choy G, Jeter C, Calhoun-Davis T, Li HW, Partial L, Pang S, Lin K, Hun JH, Ivanovo I, Suriname M, and Tang DG. The PSA-/lo prostate cancer cell population harbors self-renewing long-term tumor-propagating cells that resist castration. Cell Stem Cell. 2012 10(5): p. 556-69.
    获奖及荣誉:
    研究组成员: